Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrc1Q80VQ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrc1Q80VQ1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms