Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cfap100Q80VN0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cfap100Q80VN0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms