Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vgll4Q80V24 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms