Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NischQ80TM9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NischQ80TM9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
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