Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atf7ipQ7TT18 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atf7ipQ7TT18 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms