Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dsg1bQ7TSF1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms