Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ShprhQ7TPQ3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ShprhQ7TPQ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms