Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Shq1Q7TMX5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Shq1Q7TMX5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Shq1Q7TMX5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms