Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eci3Q78JN3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eci3Q78JN3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms