Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SynmQ70IV5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SynmQ70IV5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms