Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SpopQ6ZWS8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms