Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Opn5Q6VZZ7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Opn5Q6VZZ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms