Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b3Q6UQ17 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b3Q6UQ17 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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