Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Timd4Q6U7R4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Timd4Q6U7R4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms