Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJE0

Gfral, GDNF family receptor alpha-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GfralQ6SJE0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GfralQ6SJE0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GfralQ6SJE0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms