Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shc4Q6S5L9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms