Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja6Q6S5G4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja6Q6S5G4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms