Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ptx4Q6RUU0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptx4Q6RUU0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms