Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Med16Q6PGF3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Med16Q6PGF3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms