Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms