Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmeff1Q6PFE7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmeff1Q6PFE7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms