Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtifQ6PEE2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtifQ6PEE2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms