Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf1cQ6PDZ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms