Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc85bQ6PDY0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms