Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms