Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rundc3bQ6PDC0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rundc3bQ6PDC0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms