Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trak1Q6PD31 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trak1Q6PD31 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak1Q6PD31 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms