Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RgmaQ6PCX7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RgmaQ6PCX7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms