Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhb9Q6PB60 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms