Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab2Q6PAM0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab2Q6PAM0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms