Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atl2Q6PA06 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atl2Q6PA06 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms