Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Tsen2Q6P7W5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsen2Q6P7W5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms