Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdac10Q6P3E7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac10Q6P3E7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms