Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpbp1l1Q6NZP2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms