Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rprd2Q6NXI6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rprd2Q6NXI6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms