Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpsf6Q6NVF9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf6Q6NVF9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms