Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CltbQ6IRU5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CltbQ6IRU5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms