Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Carmil1Q6EDY6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Carmil1Q6EDY6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms