Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Smarca2Q6DIC0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Smarca2Q6DIC0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms