Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q6DFW0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q6DFW0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms