Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sptbn2Q68FG2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sptbn2Q68FG2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms