Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg9aQ68FE2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg9aQ68FE2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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