Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3ipQ68EF0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3ipQ68EF0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms