Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sdc3Q64519 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc3Q64519 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms