Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprdQ64487 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprdQ64487 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprdQ64487 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PtprdQ64487 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprdQ64487 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprdQ64487 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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