Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt12Q64291 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt12Q64291 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms