Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim24Q64127 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms