Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc18Q640L5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc18Q640L5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc18Q640L5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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