Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Tfe3Q64092 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Tfe3Q64092 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Tfe3Q64092 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tfe3Q64092 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tfe3Q64092 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms