Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm20854Q62461 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20854Q62461 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms